蒸汽加熱器是用過熱水蒸氣作為熱源，因此在使用過程中易發生泄漏而污染加熱介質，所以在制造方面要求嚴格，設備的造價也比較高；使用蒸汽進行加熱，其價格比電要便宜，但冬天要進行防凍處理。從操作上看，電加熱不會因蒸汽泄漏而影響吸附器再生的問題，所以設備造價較低。
分子篩純化器的加熱再生采用蒸汽還是電加熱與設備容量及工廠條件有關。一般設備容量較大、而且工廠有充足的蒸汽源的，多采用蒸汽加熱；設備容量較小且工廠蒸汽源有困難的，則采用電加熱。有的也采用先是蒸汽加熱而后是電加熱的。
一般在正常生產中，使用蒸汽加熱器進行加熱。當蒸汽壓力不足或分子篩需要進行活化時，才投入電加熱器，以提高加熱介質的溫度。
再生操作中應注意以下問題：
1)無論哪種加熱方式，都要注意吸附器再生過程中的加熱和冷吹的溫度曲線變化。溫度曲線的異常變化說明：
①再生熱源(蒸汽或電)不足或氣量不足；
②吸附器負荷(尤其是吸附水量)有的變化，應查明原因；
2)注意吸附器再生時的壓力變化。壓力升高說明吸附器阻力增大或吸附器的進出口閥沒關嚴，應查明原因；
3)注意加熱時間的變化。加熱時間的延長應查明是熱源問題還是吸附器的負荷增大的影響；
4)在操作蒸汽加熱器時注意：
①要經常檢查蒸汽加熱器的冷凝水的液位情況。水液位高將會影響換熱的溫度；
②當發生蒸汽換熱器漏氣時，將影響加熱再生的效果。所以要經常檢查換熱后的氣體中的含濕情況，一般水分含量應小于1×10-6(露點溫度-65℃)。否則要檢查換熱器的工作情況并進行處理。加熱器后一般設有露點檢測儀，要注意露點的變化；
5)在使用電加熱器時注意加熱介質流量不能小于工藝流量要求，否則將會發生燒毀事故。在冷吹時要注意檢查是否已斷開電源，防止燒壞電熱元件。