水稻旱育秧田由于和水育秧管理方式不同，若管理不當，容易造成死苗。其死苗原因主要有以下幾點：

1、肥害死苗。主要由于人畜糞未充分腐熟，施肥不深，肥料與土壤沒有混勻所致。另外，床土與蓋籽土含草木灰或家畜尿，造成燒根死苗。齊苗后一次追肥量過大，或施得不勻，或施用速效碳銨，或施后未及時澆水而燒苗，導致秧苗成片或呈帶狀死亡，受害輕時形成僵苗或病苗。

2、干枯死苗。一葉一心至三葉期，葉片自下而上逐步干枯而死。誘因主要有以下幾種：⑴苗床板結，耕作層淺，土壤蓄水力差，根系不能下扎，利用土壤深層養分，遇到高溫天氣株苗枯死；⑵播種過密，單株根系范圍小，削弱秧苗抗旱力。在密播條件下水肥供求矛盾突出，死苗更宜發生；⑶砂性強的土壤在三葉期，表土易形成1厘米的板結層，在水分補給時水分無法透過板結層，導致葉片卷曲不展直至干枯死亡。

3、青枯死苗。一般播種后5-7天現青后揭膜，過遲時嫩弱苗一遇異常天氣易造成死苗。晴天中午揭膜，苗宜枯死。

4、高溫燒苗。蓋膜期內，當日平均溫度在20℃以上時，膜內溫度可達50-60℃，從而導致高溫燒苗。

5、防治措施。合理施肥，提高苗床質量，適時適量追肥；適時揭膜，播后5-7天可全揭；有兩側蓋膜（應保持暢通狀態）；遮陰降溫，防止燒苗；膜內溫度在35℃以上，則用遮陽網等遮蔭。