供貯用的洋蔥以選擇黃皮、扁圓形、水分含量低、辛辣味濃、鱗莖頸部細的為宜。貯藏用洋蔥以最下方的1-2片葉干枯、地上部開始倒伏時收獲為宜。收獲后進行晾曬，將洋蔥斜向排列，使每一排莖葉正好蓋在前一排的蔥頭上，以免蔥頭受陽光直接曝曬，2-3天翻1次，一直曬至葉子發黃，需4-6天。然后將蔥葉編成長約1米的"辮子",兩條"辮子"結在一起成為一掛，每掛約60個蔥頭。編好"辮子"的洋蔥還需晾曬5-6天，曬至蔥頭充分干燥，頸部完全變成皮質時為宜。在洋蔥曬"辮子"期間，如受雨淋，洋蔥就很難再曬干，而且容易腐爛，所以晾曬期間應注意避雨。
處理好的洋蔥應隨即入貯，通常將它掛在屋檐下或室內。掛藏室要求通風良好，并保持干燥。也可用堆藏法，即在地勢高、排水好的地方，以稻草或麥稈墊底，再墊兩層葦席，然后將蔥頭一掛一掛堆高至1.50米，頂部蓋3-4層葦席，四周用葦席圍起；再用繩子橫豎扎緊，避免陽光直曬或雨水滲入。也可除去蔥葉平鋪在菜架上貯藏。
注意在貯藏前期洋蔥易腐爛，所以前期要保持干燥；貯藏后期洋蔥易抽芽，可在采收前2-3周，用0.25%新鮮素溶液噴灑洋蔥，能抑制抽芽，也可在洋蔥收獲后用0.25%的新鮮素沾根。
